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但胶原蛋白的种类要少得多，已从鱼类中分离鉴定出的胶原类型有：广泛分布在真皮、骨、鳞、鳔、肌肉等处的I型、和脊索的Ⅱ型和Ⅺ型以及肌肉的V型。而鱼皮和鱼骨所含的Ⅰ型胶原蛋白是其主要胶原蛋白。

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结果表明，用其它一些基团取代Ⅰ型胶原蛋白两条链上氨基就会导致骨合成异常。第3条α链多存在于绝大多数真骨鱼类，尤其是鱼皮，其他陆生脊椎动物没有。由3条异种α链形成的单一型杂分子α1(Ⅰ)α2(Ⅰ)α3(Ⅰ)组成，而非[α1(Ⅰ)]2α2(Ⅰ)。

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Ⅺ型胶原是异三聚体，其组成为α1(Ⅺ)α2(Ⅺ)α3(Ⅺ)，Ⅺ型胶原是的微量成分，在胶原纤维的形成和基质的组成中起着重要作用，且常与Ⅱ型胶原共存。陆生生物的组织较水生生物含量高的多，所以Ⅱ型胶原的研究的对象大多是陆生生物。